Семинар «Молекулярные методы идентификации, типирования и определения чувствительности бактерий» состоится 5–10 декабря 2011 г. в здании НИИ антимикробной химиотерапии СГМА по адресу: Смоленск, ул. Кирова, 46-А.
В программе семинара будут рассмотрены в основном вопросы видовой идентификации и субтипирования микроорганизмов с использованием молекулярных методов, а также методы выявления генетических детерминант антибиотикорезистентности.
Количество участников семинара ограничено.
Решение оргкомитета о принятии к участию в семинаре будет отправлено всем, прошедшим регистрацию, до 16 ноября.
| 5 декабря (понедельник) |
«Молекулярная диагностика инфекционных болезней» |
9.00 – 9.30 9.30 – 10.00 |
1. Регистрация участников 2. Открытие семинара |
| Лекции |
|---|
| 10.00 – 10.30 |
3. Методы амплификации нуклеиновых кислот (МАНК)
3.1. Основы ПЦР и ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) и их использование в диагностике инфекций |
| 10.30 – 10.50 |
Перерыв |
| 10.50 – 11.20 |
3.2. Методы выделения нуклеиновых кислот (НК): выбор, возможности автоматизации
3.3. Организация лаборатории. Контроль качества молекулярной диагностики |
| 11.20 – 12.20 |
Знакомство с лабораторией НИИАХ |
| 12.20 – 14.30 |
Перерыв |
| Практические занятия |
|---|
| 14:30 – 15:15 |
Выделение НК из клинических образцов (сорбционный метод).
Постановка ПЦР-РВ |
| 15:30 – 16:00 |
Микробиологическое исследование клинического материала |
| 16:00 – 16:30 |
Интерактивный опрос |
| 16:30 – 17:00 |
Учёт результатов ПЦР-РВ |
| 6 декабря (вторник) |
«Молекулярные методы видовой идентификации микроорганизмов: наука и практика» |
| Лекции |
|---|
| 9.00 – 9.30 |
4. Точная видовая идентификация бактерий — нужна ли она? |
| 9.30 – 10.00 |
5. Использование молекулярных методов для видовой идентификации культивируемых бактерий: что? когда? и зачем? |
| 10.00 – 10.20 |
Перерыв |
| 10.20 – 11.00 |
6. Методы определения нуклеотидных последовательностей генов «домашнего хозяйства» и рРНК — золотой стандарт идентификации |
| 11.00 – 12.00 |
7. Время-пролётная масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) для рутинной идентификации бактерий — революция в микробиологии |
| 12.00 – 14.00 |
Перерыв |
| Практические занятия |
|---|
| 14:00 – 15:45 |
Идентификация бактерий и грибов с помощью системы MALDI Biotyper.
Cравнение результатов микробиологического исследования, MALDI-TOF MS и ПЦР-РВ |
| 15:45 – 16:00 |
Интерактивный опрос |
| 16:00 – 17:00 |
Выделение бактериальной ДНК.
Амплификация с произвольными праймерами (AP-PCR и RAPD) (Enterobacteriaceae), MLVA (Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus) |
| 7 декабря (среда) |
«Молекулярное типирование бактерий» |
| Лекции |
|---|
| 9.00 – 9.30 |
8. Молекулярные методы субвидового типирования МО: разнообразие и области применения |
| 9.30 – 10.00 |
9. Критерии выбора и оценки эффективности методов типирования |
| 10.00 – 10.20 |
Перерыв |
| 10.20 – 10.40 |
10. Пульс-электрофорез (PFGE) макрорестрикционных фрагментов ДНК |
| 10.40 – 11.00 |
11. Амплификация с произвольными праймерами (AP-PCR и RAPD):
• Enterobacteriaceae |
| 11.00 – 11.40 |
12. Анализ множественных тандемных повторов (MLVA):
• Salmonella enterica сер. Typhimurium
• Pseudomonas aeruginosa
• Staphylococcus aureus |
| 11.40 – 12.00 |
13. Мультилокусное секвенирование-типирование (MLST):
• Pseudomonas aeruginosa
• Acinetobacter baumannii |
| 12.00 – 14.00 |
Перерыв |
| 14.00 – 14.20 |
14. Мультилокусное секвенирование-типирование (MLST):
• Haemophilus influenzae |
| 14.20 – 15.10 |
15. Примеры использования ПЦР-РВ для «генотипирования» микроорганизмов:
• Молекулярное серотипирование Streptococcus pneumoniae
• Определение пандемического клонального комплекса 235 (СС235) P. aeruginosa |
| 15.20 – 17.30 |
Экскурсия по городу |
| 8 декабря (четверг) |
«Механизмы резистентности бактерий к β-лактамным антибиотикам» |
| Лекции |
|---|
| 9.00 – 9.30 |
16. Генетическая природа резистентности. Природная и приобретённая резистентность. Роль мобильных генетических элементов. |
| 9.20 – 10.00 |
17. Разнообразие механизмов устойчивости к β-лактамам у различных видов бактерий:
17.1. Модификация и приобретение дополнительных ПСБ (Streptococcus pneumoniae; Staphylococcus spp. (MRS));
17.2. Эффлюкс (Pseudomonas aeruginosa — карбапенемы);
17.3. Изменение проницаемости наружной мембраны (Klebsiella pneumoniae — карбапенемы);
17.4. Продукция β-лактамаз — основной механизм резистентности Грам(-) бактерий |
| 10.00 – 10.20 |
Перерыв |
| 10.20 – 10.40 |
18. Разнообразие и классификация β-лактамаз |
| 10.40 – 11.00 |
19. Природные β-лактамазы энтеробактерий и некоторых ГНБ |
| 11.00 – 12.00 |
20. Наиболее значимые приобрётенные β-лактамазы:
20.1. β-лактамазы расширенного спектра класса A (ESBL)
20.2. Карбапенемазы класса B — металло-β-лактамазы (MBL)
20.3. Карбапенемазы класса A (KPC и др.)
20.2. Карбапенемазы класса D (CHDL: OXA) |
| 12.00 – 14.00 |
Перерыв |
| Практические занятия |
|---|
| 14:00 – 15:00 |
Электрофорез продуктов AP-PCR и MLVA |
| 15:00 – 16:30 |
Интерпретация результатов типирования. Оценка родственности, кластеризация, построение дендрограмм |
| 16:30 – 17:00 |
Интерактивный опрос |
| 9 декабря (пятница) |
«Классические методы определения чувствительности к антибактериальным препаратам и дополнительные фенотипические тесты» |
| Лекции |
|---|
| 9.00 – 9.30 |
21. Стандарты определения чувствительности. Выбор критериев интерпретации. Существующие стандарты. |
| 9.30 – 10.00 |
22. Методы определения чувствительности микроорганизмов к антибиотикам в практике микробиологической лаборатории |
| 10.00 – 10.20 |
Перерыв |
| 10.20 – 10.40 |
23. Фенотипическая детекция оксациллин-резистентности у стафилококков |
| 10.40 – 11.30 |
24. Фенотипические тесты для выявления наиболее значимых β-лактамаз:
24.1. Определение ESBL (синергизм с клавулановой кислотой);
24.2. Определение карбапенемаз (модифицированный Hodge тест; гидролиз карбапенемов в растворе);
24.3. Определение MBL (синергизм с ЭДТА и ДПК). |
| 11.30 – 13.30 |
Перерыв |
| Практические занятия |
|---|
| 13.30 – 14.00 |
Интерактивный опрос |
| 14.00 – 14.30 |
Фенотипическая детекция MRSA |
| 14:30 – 15:00 |
Фенотипическая детекция ESBL и MBL у Грам(-) бактерий |
| 15:00 – 17:00 |
Постановка ПЦР-РВ для детекции mecA (стафилококки) Постановка ПЦР-РВ для детекции приобретённых карбапенемаз и ESBL (ГНБ и энтеробактерии) |
| 10 декабря (суббота) |
«Молекулярно-генетические методы исследования антибиотикорезистентности» |
| Лекции |
|---|
| 9.00 – 9.30 |
25. Применение молекулярных методов для быстрой детекции и изучения эпидемиологии антибиотикорезистентности |
| 9.30 – 10.00 |
26. Выявление и характеристика наиболее значимых приобретённых β-лактамаз с помощью методов ПЦР-РВ |
| 10.00 – 10.20 |
Перерыв |
| 10.20 – 11.00 |
27. Перспективы использования технологии ДНК-чипов для определения детерминант антибиотикорезистентности |
| 11.00 – 13.00 |
Перерыв |
| Практические занятия |
|---|
| 13.00 – 13.30 |
Учёт и сравнение результатов выявления детерминант резистентности с помощью фенотипических тестов и ПЦР-РВ |
| 13.30 – 14.30 |
Обсуждение результатов |
| 14:30 – 15:30 |
Подведение итогов семинара |
Адрес: 214000, ул. Ленина, 2/1
Стоимость, руб. (без 25% за бронь):
Адрес: 214000, ул. Дзержинского, 23/2
Стоимость, руб. (без 25% за бронь), в стоимость включены завтраки:
Адрес: 214000, ул. Бакунина, 2-В
Стоимость, руб. (в стоимость включены завтраки):
