English

IV научно-практический семинар по молекулярной бактериологии

«Молекулярные методы идентификации и типирования бактерий»

2–4 декабря 2013 г.

«Фенотипические и молекулярные методы определения антибиотикорезистентности»

5–7 декабря 2013 г.

Уважаемые коллеги!

В 2013 году в связи с расширением программы семинар по молекулярной бактериологии, традиционно проводимый НИИАХ и МАКМАХ, был разделён на 2 части:

• Молекулярные методы идентификации и типирования бактерий (2-4 декабря)

• Фенотипические и молекулярные методы определения антибиотикорезистентности (5-7 декабря)

Программа семинара включала лекции, практические занятия в учебной лаборатории и обсуждение результатов. На практических занятиях участникам предлагалось выполнение демонстрационных задач и возможность исследования собственных культур микроорганизмов.

Место проведения: НИИ антимикробной химиотерапи (НИИАХ)и ГБОУ ВПО СГМА Минздрава России, Смоленск, ул. Кирова, 46 А (Яндекс-Карта)

Стоимость участия:

• в одной из частей семинара — 10 тыс. руб.
• в двух частях (2-7 декабря) — 15 тыс. руб.

Оплата транспортных расходов и проживания осуществлялась участниками отдельно (организационный комитет не осуществляет бронирование гостиниц). Информацию о гостиницах Вы можете найти на сайте «Гостиницы Смоленска».

По всем интересующим Вас вопросам Вы можете обращаться по телефону: +7 (4812) 450602 доб. 125 или по электронной почте: Elena.Skleenova@antibiotic.ru

Предварительная программа семинара

Часть I. «Молекулярные методы идентификации и типирования бактерий»

1. Внедрение молекулярно-генетических методов в практику работы микробиологических лабораторий.
2. Методы амплификации нуклеиновых кислот (МАНК). ПЦР и ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ), другие МАНК и их использование в диагностике инфекций.
3. Параллельное исследование клинических образцов с помощью культуральных и молекулярно-генетических методов. Преаналитические требования, этапы анализа, интерпретация результатов.
4. Организация лаборатории. Контроль качества молекулярной диагностики. Автоматизация.
5. Использование молекулярных методов для видовой идентификации культивируемых бактерий: что? когда? и зачем?
6. Секвенирование генов рРНК и других генов «домашнего хозяйства» — золотой стандарт идентификации.
7. Время-пролетная масс-спектрометрия (MALDI-TOF MS) для рутинной идентификации бактерий — революция в микробиологии. Применение MALDI-TOF MS для субвидового типирования бактерий.
8. Молекулярные методы субвидового типирования бактерий: разнообразие и области применения.
9. Критерии выбора и оценки эффективности методов типирования.
10. Методы, основанные на анализе электрофоретических профилей: пульс-электрофорез макрорестрикционных фрагментов ДНК (PFGE); амплификация с произвольными праймерами и праймерами к повторяющимся последовательностям (RAPD, AP-PCR, ERIC, Rep-PCR).
11. Анализ множественных тандемных повторов (MLVA). Примеры: Salmonella enterica, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus.
12. Мультилокусное секвенирование-типирование (MLST). Примеры: Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Salmonella enterica, Staphylococcus aureus, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae.
13. Использование ПЦР-РВ для «генотипирования» микроорганизмов. Примеры: молекулярное серотипирование Streptococcus pneumoniae; мультилокусное SNP-типирование Pseudomonas aeruginosa CC235.
14. Использование методов секвенирования следующего поколения и полногеномного секвенирования для типирования микроорганизмов. rMLTS.
15. Программное обеспечение и методы анализа данных молекулярно-генетического типирования.

Часть II. «Фенотипические и молекулярные методы определения антибиотикорезистентности»

1. Генетическая природа резистентности. Природная и приобретённая резистентность. Роль мобильных генетических элементов.
2. Механизмы устойчивости к бета-лактамным антибиотикам у различных видов бактерий.
3. Модификация и приобретение дополнительных ПСБ (Streptococcus pneumoniae; Staphylococcus spp.).
4. Эффлюкс (Pseudomonas aeruginosa — карбапенемы).
5. Изменение проницаемости наружной мембраны (Enterobacteriaceae — карбапенемы).
6. Продукция бета-лактамаз. Разнообразие и классификация бета-лактамаз.
7. Природные бета-лактамазы грамотрицательных бактерий.
8. Наиболее значимые приобретенные бета-лактамазы: ESBL, карбапенемазы различных классов.
9. Методы определения чувствительности микроорганизмов к антибиотикам в практике микробиологической лаборатории.
10. Стандарты определения чувствительности. Выбор критериев интерпретации. Существующие стандарты.
11. Новые и экспериментальные методы ускоренной оценки чувствительности к антибиотикам: MALDI-TOF MS, другие методы.
12. Определение чувствительности к комбинациям антибиотиков.
13. Дополнительные фенотипические и молекулярные методы определения резистентности. Использование дополнительных тестов при переходе на новые критерии оценки чувствительнсти CLSI и EUCAST.
14. Возможности и ограничения молекулярных методов оценки антибиотикорезистентности. Выявление мутаций, приобретенных генов и характеристика мобильных элементов. Анализ с использованием онлайн баз данных.
15. Определение MRSA: фенотипические и молекулярные тесты.
16. Определение ESBL и карбапенемаз. Фенотипические тесты: оценка синергизма различных бета-лактамных субстратов с ингибиторами, модифицированный Hodge тест, Carba-NP тест. Молекулярные тесты: определение генов бета-лактамаз и точечных мутаций с помощью ПЦР-РВ.