1. Верно ли утверждение, что по наличию плазмид можно судить о принадлежности микроорганизма к госпитальному штамму?
2. Для чего они вообще служат?
3. Как используются плазмиды в эпиданализе и какое значение они имеют при расшифровке этиологии госпитальных инфекций?
Сотрудник НИИАХ Posts: 83
Уважаемый коллега,
14.05.2006 08:52 Anonymous писал(а):
Уважаемые коллеги!
У меня несколько вопросов:
1. Верно ли утверждение, что по наличию плазмид можно судить о принадлежности микроорганизма к госпитальному штамму?
НЕТ. Плазмиды широко распространены у любых природных штаммов различных видов микроорганизмов, в том числе у непатогенных. Очень часто плазмиды кодируют свойства НЕ связанные с патогенностью.
2. Для чего они вообще служат?
Все зависит от того, «кому служат». Если речь о бактериях, то плазмиды, как и любые другие «носители» генетической информации (хромосома, фаги), определяют самые разнообразные свойства. Обязательное только одно - самовоспроизведение. Для плазмид патогенных бактерий важными (с точки зрения человека) могут быть: способность к передаче при конъюгации, устойчивость к различным антимикробным препаратам и дезинфектантам, продукция некоторых факторов патогенности...
Если речь о человеке, то плазмиды, в первую очередь, используются как «генетические векторы» в биотехнологии и при проведении исследований.
Эпиданализ - далеко не самое важное «назначение» плазмид.
3. Как используются плазмиды в эпиданализе и какое значение они имеют при расшифровке этиологии госпитальных инфекций?
В России традиционно преувеличивается значение определения плазмидных профилей в эпиданализе. Вероятно, из-за того, что грубое выделение плазмид (их может быть несколько у одного штамма) и электрофорез - сравнительно простые процедуры. Причины неэффективности простого сравнения профилей плазмид следующие:
Различные плазмиды могут иметь сходную молекулярную массу и выглядеть одинаково на электрофорезе;
Наличие плазмид непостоянное свойство, они могут приобретаться (при конъюгации) или теряться (элиминироваться) в течении ряда генераций;
Часто родственные плазмиды выглядят по-разному на геле из-за разной степени компактизации (суперскрученности) или изменения размера (природные плазмиды постоянно эволюционируют - могут терять или приобретать участки ДНК).
НО (!) есть ситуации, когда сравнение плазмид действительно важно при эпиданализе. Речь идёт о сравнении определённых(!) плазмид, которые кодируют интересующую функцию, например, резистентность к какой-либо группе антибиотиков. В этом случае обычно отдельные(!) сравниваемые плазмиды, полученные от разных штаммов, подвергаются расщеплению рестриктазами. Рестрикционные фрагменты разделяются с помощью электрофореза, и полученные профили фрагментов сравниваются между собой.
Такой анализ может быть полезен, например, для доказательства переноса определённого гена (свойства) между разными штаммами конъюгативной плазмидой.
