Добрый день! Подскажите, пожалуйста, как используются плазмиды в эпиданализе и какое значение они имеют при расшифровке этиологии госпитальных инфекций? Верно ли утверждение, что по наличию плазмид можно судить о принадлежности микроорганизма к госпитальному штамму? Если нет, то для чего они вообще служат?
Сотрудник НИИАХ Posts: 83
Верно ли утверждение, что по наличию плазмид можно судить о принадлежности микроорганизма к госпитальному штамму?
НЕТ. Плазмиды широко распространены у любых природных штаммов различных видов микроорганизмов, в том числе у непатогенных. Очень часто плазмиды кодируют свойства НЕ связанные с патогенностью.
для чего они вообще служат?
Всё зависит от того, «кому служат». Если речь о бактериях, то плазмиды, как и любые другие «носители» генетической информации (хромосома, фаги), определяют самые разнообразные свойства. Обязательное только одно - самовоспроизведение. Для плазмид патогенных бактерий важными (с точки зрения человека) могут быть: способность к передаче при конъюгации, устойчивость к различным антимикробным препаратам дезинфектантам, продукция некоторых факторов патогенности... Если речь о человеке, то плазмиды, в первую очередь, используются как «генетические векторы» в биотехнологии и при проведении исследований. Эпиданализ - далеко не самое важное «назначение» плазмид.
как используются плазмиды в эпиданализе и какое значение они имеют при расшифровке этиологии госпитальных инфекций?
В России традиционно преувеличивается значение определения плазмидных профилей в эпиданализе. Вероятно из-за того, что грубое выделение плазмид (их может быть несколько у одного штамма) и электрофорез - cравнительно простые процедуры. Причины неэффективности простого сравнения профилей плазмид следующие:
Различные плазмиды могут иметь сходную молекулярную массу и выглядеть одинаково на электрофорезе;
Наличие плазмид непостоянное свойство, они могут приобретаться (при конъюгации) или теряться (элиминироваться) в течении ряда генераций;
Часто родственные плазмиды выглядят по-разному на геле из-за разной степени компактизации (суперскрученности) или изменения размер(природные плазмиды постоянно эволюционируют - могут терять или приобретать участки ДНК).
НО(!) есть ситуации, когда сравнение плазмид действительно важно при эпиданализе. Речь идёт о сравнении определённых(!) плазмид, которые кодируют интересующую функцию, например, резистентность к какой-либо группе антибиотиков. В этом случае обычно отдельные(!) сравниваемые плазмиды, полученные от разных штаммов, подвергаются расщеплению рестриктазами. Рестрикционные фрагменты разделяются с помощью электрофореза и полученные профили фрагментов сравниваются между собой. Такой анализ может быть полезен, например, для доказательства переноса определенного гена (свойства) между разными штаммами конъюгативной плазмидой.
